Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms