Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms