Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms