Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms