Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms