Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms