Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms