Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms