Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms