Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MC1RQ01726 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms