Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms