Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms