Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms