Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms