Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms