Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAV3P56539 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAV3P56539 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAV3P56539 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAV3P56539 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAV3P56539 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms