Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms