Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPAP53621 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPAP53621 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPAP53621 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms