Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK1EP49674 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1EP49674 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms