Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A6P48664 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms