Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ME1P48163 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ME1P48163 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms