Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPOP42166 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPOP42166 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPOP42166 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms