Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKARP32238 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms