Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAR1BP31321 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms