Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms