Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms