Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD27P26842 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD27P26842 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD27P26842 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms