Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms