Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms