Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF3P18847 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms