Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOT1P17174 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOT1P17174 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOT1P17174 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOT1P17174 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOT1P17174 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms