Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms