Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms