Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MMP10P09238 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms