Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GADD45GO95257 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms