Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDM4BO94953 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms