Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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UBXN7O94888 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN7O94888 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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