Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF254O75437 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF254O75437 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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