Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP5O75197 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP5O75197 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5O75197 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5O75197 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5O75197 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5O75197 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP5O75197 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP5O75197 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP5O75197 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP5O75197 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms