Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms