Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE8AO60658 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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