Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEF1E1O43324 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EEF1E1O43324 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms