Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF10O15013 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms