Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms