Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PATL2C9JE40 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms