Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms