Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF25A6NGN4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms