Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD54BQ9Y620 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD54BQ9Y620 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD54BQ9Y620 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD54BQ9Y620 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAD54BQ9Y620 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms