Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP164Q9UPV0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP164Q9UPV0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms