Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms